Mikel Astarloza, 18° di tappa a 2'44" da Garate e 11° nella generale a 14'44" da Contador, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Alberto Contador Velasco | in 81h46'17" | Spagna | Astana |
| 2 | Andy Schleck | a 4'11" | Lussemburgo | Team Saxo Bank |
| 3 | Lance Armstrong | a 5'24" | Usa | Astana |
| 4 | Bradley Wiggins | a 6'01" | Belgio | Garmin - Slipstream |
| 5 | Fränk Schleck | a 6'04" | Lussemburgo | Team Saxo Bank |
| 6 | Andreas Klöden | a 6'42" | Germania | Astana |
| 7 | Vincenzo Nibali | a 7'35" | Italia | Liquigas |
| 8 | Christian Vande Velde | a 12'04" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 9 | Roman Kreuziger | a 14'16" | Repubblica Ceca | Liquigas |
| 10 | Christophe Le Mével | a 14'25" | Francia | Française des Jeux |
| 11 | Sandy Casar | a 17'19" | Francia | Française des Jeux |
| 12 | Vladimir Karpets | a 18'34" | Russia | Team Katusha |
| 13 | Rinaldo Nocentini | a 20'45" | Italia | AG2R La Mondiale |
| 14 | Jurgen Van den Broeck | a 20'50" | Belgio | Silence - Lotto |
| 15 | Stéphane Goubert | a 22'29" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 16 | Carlos Sastre Candil | a 26'21" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 17 | Alexandre Botcharov | a 29'33" | Russia | Team Katusha |
| 18 | George Hincapie | a 33'27" | Usa | Team Columbia - High Road |
| 19 | Sylvain Chavanel | a 34'09" | Francia | Quick Step |
| 20 | Christian Knees | a 34'48" | Germania | Team Milram |
| 21 | Pierre Rolland | a 37'44" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 22 | Nicolas Roche | a 38'20" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 23 | Linus Gerdemann | a 38'35" | Germania | Team Milram |
| 24 | Brice Feillu | a 41'14" | Francia | Agritubel |
| 25 | Luis León Sánchez Gil | a 41'27" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 26 | Maxime Monfort | a 43'20" | Belgio | Team Columbia - High Road |
| 27 | Haimar Zubeldia Agirre | a 43'34" | Spagna | Astana |
| 28 | Christophe Moreau | a 44'33" | Francia | Agritubel |
| 29 | Cadel Evans | a 45'24" | Australia | Silence - Lotto |
| 30 | Nicki Sørensen | a 46'34" | Danimarca | Team Saxo Bank |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Juan Manuel Gárate Cepa | in 4h39'21" | Spagna | Rabobank |
| 2 | Tony Martin | a 3" | Germania | Team Columbia - High Road |
| 3 | Andy Schleck | a 38" | Lussemburgo | Team Saxo Bank |
| 4 | Alberto Contador Velasco | a 38" | Spagna | Astana |
| 5 | Lance Armstrong | a 41" | Usa | Astana |
| 6 | Fränk Schleck | a 43" | Lussemburgo | Team Saxo Bank |
| 7 | Roman Kreuziger | a 46" | Repubblica Ceca | Liquigas |
| 8 | Franco Pellizotti | a 56" | Italia | Liquigas |
| 9 | Vincenzo Nibali | a 58" | Italia | Liquigas |
| 10 | Bradley Wiggins | a 1'03" | Belgio | Garmin - Slipstream |
| 11 | Jurgen Van den Broeck | a 1'39" | Belgio | Silence - Lotto |
| 12 | Andreas Klöden | a 1'42" | Germania | Astana |
| 13 | Christophe Riblon | a 1'47" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 14 | Joost Posthuma | a 1'56" | Olanda | Rabobank |
| 15 | Christophe Le Mével | a 2'26" | Francia | Française des Jeux |
| 16 | Christian Vande Velde | a 2'34" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 17 | Maxime Bouet | a 2'42" | Francia | Agritubel |
| 18 | Daniele Righi | a 3'03" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 19 | Sylvain Calzati | a 3'15" | Francia | Agritubel |
| 20 | Luis León Sánchez Gil | a 3'15" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 21 | Sandy Casar | a 3'20" | Francia | Française des Jeux |
| 22 | Stéphane Goubert | a 3'20" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 23 | Peter Velits | a 4'23" | Slovacchia | Team Milram |
| 24 | Igor Antón Hernández | a 4'37" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 25 | Hayden Roulston | a 5'07" | Nuova Zelanda | Cervélo Test Team |
| 26 | Sébastien Minard | a 5'11" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 27 | Vladimir Karpets | a 5'36" | Russia | Team Katusha |
| 28 | Yury Trofimov | a 5'40" | Russia | Bbox Bouygues Telecom |
| 29 | Chris Anker Sørensen | a 5'42" | Danimarca | Team Saxo Bank |
| 30 | Nicki Sørensen | a 5'42" | Danimarca | Team Saxo Bank |
