Mikel Astarloza, 1° di tappa in 4h14'20" e 11° nella generale a 4'38" da Contador, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | Matthew Lloyd | a 51'23" | Australia | Silence - Lotto |
| 62 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 52'40" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 63 | Amaël Moinard | a 55'15" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 64 | Juan Manuel Gárate Cepa | a 55'55" | Spagna | Rabobank |
| 65 | Ryder Hesjedal | a 55'59" | Canada | Garmin - Slipstream |
| 66 | David Loosli | a 56'39" | Svizzera | Lampre - N.G.C. |
| 67 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 57'26" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 68 | Maxime Bouet | a 59'15" | Francia | Agritubel |
| 69 | Geoffroy Lequatre | a 59'19" | Francia | Agritubel |
| 70 | David Zabriskie | a 59'47" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 71 | David Millar | a 1h00'14" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 72 | Thomas Voeckler | a 1h03'07" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 73 | Johannes Fröhlinger | a 1h03'37" | Germania | Team Milram |
| 74 | Fabian Cancellara | a 1h04'09" | Svizzera | Team Saxo Bank |
| 75 | Sylvain Calzati | a 1h08'49" | Francia | Agritubel |
| 76 | Joan Horrach Rippoll | a 1h12'36" | Spagna | Team Katusha |
| 77 | José Joaquín Rojas Gil | a 1h12'54" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 78 | David Arroyo Duran | a 1h13'26" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 79 | Sebastian Lang | a 1h13'53" | Germania | Silence - Lotto |
| 80 | Iñigo Cuesta López De Castro | a 1h15'23" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 81 | Frederik Willems | a 1h16'13" | Belgio | Liquigas |
| 82 | José Luis Arrieta Lujambio | a 1h16'50" | Spagna | AG2R La Mondiale |
| 83 | Christophe Kern | a 1h18'13" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 84 | Rubén Pérez Moreno | a 1h18'50" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 85 | Marzio Bruseghin | a 1h20'14" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 86 | Heinrich Haussler | a 1h21'05" | Australia | Cervélo Test Team |
| 87 | Hayden Roulston | a 1h21'58" | Nuova Zelanda | Cervélo Test Team |
| 88 | Greg Van Avermaet | a 1h23'34" | Belgio | Silence - Lotto |
| 89 | Joost Posthuma | a 1h24'39" | Olanda | Rabobank |
| 90 | Christophe Riblon | a 1h24'52" | Francia | AG2R La Mondiale |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | Egoi Martínez de Esteban | a 10'36" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 62 | Sebastian Lang | a 10'36" | Germania | Silence - Lotto |
| 63 | Geoffroy Lequatre | a 10'36" | Francia | Agritubel |
| 64 | Staf Scheirlinckx | a 10'36" | Belgio | Silence - Lotto |
| 65 | Maxime Bouet | a 10'36" | Francia | Agritubel |
| 66 | Sylvain Calzati | a 10'36" | Francia | Agritubel |
| 67 | George Hincapie | a 10'36" | Usa | Team Columbia - High Road |
| 68 | Leonardo Fabio Duque | a 10'36" | Colombia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 69 | Greg Van Avermaet | a 10'36" | Belgio | Silence - Lotto |
| 70 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 10'36" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 71 | Marzio Bruseghin | a 10'36" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 72 | Nicki Sørensen | a 10'36" | Danimarca | Team Saxo Bank |
| 73 | David Arroyo Duran | a 10'36" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 74 | Gustav Erik Larsson | a 12'25" | Svezia | Team Saxo Bank |
| 75 | Alessandro Vanotti | a 15'19" | Italia | Liquigas |
| 76 | José Joaquín Rojas Gil | a 16'34" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 77 | Stijn Vandenbergh | a 16'34" | Belgio | Team Katusha |
| 78 | Joost Posthuma | a 16'34" | Olanda | Rabobank |
| 79 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 16'34" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 80 | Yukiya Arashiro | a 16'34" | Giappone | Bbox Bouygues Telecom |
| 81 | David Moncoutié | a 16'34" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 82 | Tony Martin | a 16'34" | Germania | Team Columbia - High Road |
| 83 | Fabian Wegmann | a 16'34" | Germania | Team Milram |
| 84 | Denis Menchov | a 16'34" | Russia | Rabobank |
| 85 | Johannes Fröhlinger | a 16'34" | Germania | Team Milram |
| 86 | Matthew Lloyd | a 16'34" | Australia | Silence - Lotto |
| 87 | David Millar | a 20'33" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 88 | Julian Dean | a 20'33" | Nuova Zelanda | Garmin - Slipstream |
| 89 | Ryder Hesjedal | a 20'33" | Canada | Garmin - Slipstream |
| 90 | Danny Pate | a 20'33" | Usa | Garmin - Slipstream |
