| 43 | José Carlos Lara Arjonilla | a 1'28" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 44 | Carlos Andres Ibáñez González | a 1'28" | Colombia | Café de Colombia - Colombia es Pasión |
| 45 | Egoitz García Etxeguibel | a 1'28" | Spagna | Caja Rural |
| 95 | Aritz Etxebarria Etxebarria | a 11'41" | Spagna | Orbea |
| 96 | Pablo Urtasun Pérez | a 11'41" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 97 | Jonathan Castroviejo Nicolas | a 12'02" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 98 | Gorka Izagirre Insausti | a 12'04" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 99 | Tiago Silva | a 12'04" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé - Louletano |
| 100 | Miguel Mínguez Ayala | a 12'04" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 46 | Vladimir Isaichev | a 2'16" | Russia | Xacobeo Galicia |
| 47 | Enrique Mata | a 2'16" | Spagna | Footon - Servetto |
| 48 | Ricardo García Ambroa | a 2'16" | Spagna | Orbea |
| 49 | Lluís Guillermo Mas Bonet | a 2'16" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 50 | Pedro Miguel Miranda Soeiro | a 2'16" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé - Louletano |
| 51 | Gustavo Rodríguez Iglesias | a 2'16" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 52 | Ricardo Mestre | a 2'16" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 53 | Mickaël Buffaz | a 2'16" | Svizzera | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 54 | Nico Sijmens | a 2'16" | Belgio | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 55 | Jonathan Perdiguero | a 2'16" | Spagna | |
| 56 | Rémi Cusin | a 2'16" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 57 | Krzysztof Szczawinski | a 2'16" | Polonia | Miche |
| 58 | Gustavo Domínguez Lemos | a 2'16" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 59 | Nelson Nuno Sequeira Vitorino | a 2'16" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 60 | Bruno Antonio Ferreira Pinto | a 2'16" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé - Louletano |
| 61 | Fader Andres Ardila Cano | a 2'16" | Colombia | Café de Colombia - Colombia es Pasión |
| 62 | Antonio Piedra Pérez | a 2'16" | Spagna | Andalucía - Cajasur |
| 63 | José Vicente Toribio Alcolea | a 2'16" | Spagna | Andalucía - Cajasur |
| 64 | Ivan Melero Coco | a 2'16" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 65 | Diego Gallego Arnaiz | a 2'16" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 66 | Eloy Carral | a 2'16" | Spagna | |
