| 4 | Patrick Sinkewitz | a 1'32" | Germania | PSK Whirlpool - Author |
| 5 | Andre Fernando Santos Martins Cardoso | a 1'38" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 6 | David Blanco Rodríguez | a 1'47" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 7 | Nelson Nuno Sequeira Vitorino | a 1'49" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 8 | Eladio Jiménez Sánchez | a 1'53" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé - Louletano |
| 9 | Rubén Plaza Molina | a 1'54" | Spagna | Liberty Seguros |
| 29 | David Vaz de Matos | a 10'15" | Portogallo | LA - Rota dos Moveis |
| 30 | Bruno José Pereira Barbosa | a 10'32" | Portogallo | LA - Rota dos Moveis |
| 31 | Filipe Duarte Sousa Cardoso | a 11'39" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 32 | Damiano Caruso | a 14'08" | Italia | G.S. Mastromarco - Sensi - Mapooro [Dilettanti] |
| 33 | Pedro Fernández Hermida | a 14'31" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 34 | Sergio Ferreira Sousa | a 14'49" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 35 | Célio Cristiano Alves Sousa | a 15'36" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 36 | Luis Pinheiro | a 16'21" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 37 | Geert Verheyen | a 16'28" | Belgio | Landbouwkrediet - Colnago |
| 38 | José Luis Roldan Carmona | a 16'41" | Spagna | Andalucía Cajasur |
| 39 | Marco Marzano | a 17'26" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 40 | Cristiano Salerno | a 17'40" | Italia | LPR Brakes Farnese Vini |
| 41 | David Da Silva Livramento | a 18'03" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 42 | Dario David Cioni | a 18'54" | Gran Bretagna | ISD |
| 98 | Emanuele Bindi | a 1h01'30" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 99 | Massimiliano Mori | a 1h02'16" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 100 | Dirk Bellemakers | a 1h03'58" | Olanda | Landbouwkrediet - Colnago |
| 101 | Andrea Grendene | a 1h06'44" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 102 | Bruno Matos Sancho | a 1h08'55" | Portogallo | LA - Rota dos Moveis |
| 103 | Alejandro Paleo | a 1h10'34" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 104 | Ivan Rana Fuentes | a 1h12'08" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 105 | Francesco Tomei | a 1h12'12" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 106 | Mikel Gaztañaga Echevarria | a 1h12'38" | Spagna | Contentpolis - Ampo |
| 107 | Alessandro Colò | a 1h15'16" | Italia | ISD |
