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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 6 | Alexis Rodríguez Hernández | a 1'05" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 7 | Massimo Codol | a 1'05" | Italia | Acqua & Sapone - Caffè Mokambo |
| 8 | Vicente David Bernabéu Armengol | a 1'15" | Spagna | Barbot - Siper |
| 9 | Nuno Jorge Gaspar Ribeiro | a 1'19" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 10 | Enrique Salgueiro Alonso | a 1'21" | Spagna | Extremadura |
| 11 | Rui Alberto Faria da Costa | a 1'22" | Portogallo | Benfica |
| 12 | Danail Andonov Petrov | a 1'25" | Bulgaria | Benfica |
| 13 | Virgilio Martins Dos Santos | a 1'28" | Portogallo | Fercase - Rota dos Móveis |
| 14 | Francisco Mancebo Pérez | a 1'28" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 15 | Bruno Manuel Silva Pires | a 1'32" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 16 | Delio Fernández Cruz | a 1'41" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 17 | Francesco Failli | a 1'48" | Italia | Acqua & Sapone - Caffè Mokambo |
| 18 | Nelson Nuno Sequeira Vitorino | a 1'50" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 19 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 1'56" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 42 | Gustavo Rodríguez Iglesias | a 10'14" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 43 | Hernâni Brôco | a 11'42" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 44 | Olivier Bonnaire | a 14'30" | Francia | Bouygues Telecom |
| 45 | Mikel Pradera Rodríguez | a 15'42" | Spagna | Benfica |
| 46 | Luca Pierfelici | a 17'14" | Italia | Acqua & Sapone - Caffè Mokambo |
| 47 | Jeremy Hunt | a 17'23" | Canada | Crédit Agricole |
| 48 | Alberto Rodríguez Oliver | a 19'41" | Spagna | Contentpolis Murcia |
| 20 | Andre Fernando Santos Martins Cardoso | a 2'02" | Portogallo | Fercase - Rota dos Móveis |
| 21 | Antonio D'Aniello | a 2'04" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 22 | Eladio Jiménez Sánchez | a 2'08" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 23 | Tiago Jose Pinto Machado | a 2'18" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 24 | Oleg Chuzhda | a 2'38" | Ucraina | Contentpolis Murcia |
| 25 | Adrian Palomares Villaplana | a 2'46" | Spagna | Contentpolis Murcia |
| 26 | Rogério Fernando Silva Batista | a 2'53" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 27 | Dainius Kairelis | a 2'55" | Lituania | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 2 | Constantino Zaballa Gutiérrez | a 21" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 23 | Nuno Jorge Gaspar Ribeiro | a 1'00" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 24 | Adrian Palomares Villaplana | a 1'03" | Spagna | Contentpolis Murcia |
| 25 | Nelson Nuno Sequeira Vitorino | a 1'03" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 26 | Oleg Chuzhda | a 1'05" | Ucraina | Contentpolis Murcia |
| 27 | Helder Antonio Duarte Miranda | a 1'05" | Portogallo | Benfica |
| 28 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 1'05" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 29 | Vicente David Bernabéu Armengol | a 1'05" | Spagna | Barbot - Siper |
| 30 | Gustavo Rodríguez Iglesias | a 1'07" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 31 | Hernâni Brôco | a 1'13" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 32 | Bruno José Pereira Barbosa | a 1'16" | Portogallo | Fercase - Rota dos Móveis |
| 33 | Bruno Manuel Silva Pires | a 1'16" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 34 | Rogério Fernando Silva Batista | a 1'16" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 35 | Sergio Ferreira Sousa | a 1'20" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 36 | David Da Silva Livramento | a 1'28" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 37 | Francisco José Terciado Sacedo | a 1'40" | Spagna | Extremadura |
| 38 | Julien Belgy | a 1'48" | Francia | Bouygues Telecom |
| 39 | José Ramon Troncoso Sobrino | a 1'52" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 40 | Hugo Manuel Vitor Izidoro | a 1'52" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 41 | Mikel Pradera Rodríguez | a 1'52" | Spagna | Benfica |
| 42 | Luis Fernández Oliveira | a 1'52" | Spagna | Barbot - Siper |
| 54 | Joaquim Antonio Bras Gregorio | a 13'14" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 2 | Ricardo Mestre | a 17" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 43 | Jeremy Hunt | a 2'02" | Canada | Crédit Agricole |
| 3 | Eladio Jiménez Sánchez | a 22" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 44 | Pedro Fernández Hermida | a 3'10" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 45 | Vitor Hugo Rocha Rodrigues | a 3'14" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 46 | André Moreira Vital | a 3'26" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 47 | José Antonio Garrido Lima | a 3'26" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 4 | Antonio D'Aniello | a 38" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 5 | Dainius Kairelis | a 38" | Lituania | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
