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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 14 | Pedro Romero Ocampo | a 1'04" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 15 | Tiago Jose Pinto Machado | a 1'06" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 16 | Thomas Voeckler | a 1'09" | Francia | Bouygues Telecom |
| 17 | Hugo Sabido | a 1'12" | Portogallo | Barloworld |
| 18 | Dennis Van Winden | a 1'14" | Olanda | Rabobank #Continental |
| 19 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 1'14" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 20 | Eduard Vorganov | a 1'20" | Russia | Xacobeo Galicia |
| 21 | Dmitriy Muravyev | a 1'21" | Kazakistan | Astana |
| 22 | Francisco José Pacheco Torres | a 1'24" | Spagna | Barbot - Siper |
| 23 | Martijn Keizer | a 1'24" | Olanda | Rabobank #Continental |
| 24 | Johannes Fröhlinger | a 1'28" | Germania | Gerolsteiner |
| 25 | Joaquim Alberto Campos Sampaio | a 1'30" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 26 | Tejay Van Garderen | a 1'32" | Usa | Rabobank #Continental |
| 27 | Isidro Nozal Vega | a 1'33" | Spagna | Liberty Seguros |
| 28 | Francisco Mancebo Pérez | a 1'35" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 29 | Andrey Mizurov | a 1'38" | Kazakistan | Astana |
| 30 | Ángel Vicioso Arcos | a 1'39" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 31 | Leonardo Fabio Duque | a 1'41" | Colombia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 32 | Xavier Tondo Volpini | a 1'46" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 33 | Francesco De Bonis | a 1'48" | Italia | Gerolsteiner |
| 34 | Sergio Ferreira Sousa | a 1'52" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 35 | Daryl Impey | a 1'53" | Sudafrica | Barloworld |
| 36 | Thomas Frei | a 1'57" | Svizzera | Astana |
| 2 | Laszlo Bodrogi | a 11" | Ungheria | Crédit Agricole |
| 3 | Andreas Klöden | a 15" | Germania | Astana |
| 123 | Maryan Hary | a 15'24" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 124 | Stéphane Augé | a 15'41" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 125 | Dainius Kairelis | a 15'49" | Lituania | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 126 | Laurent Lefèvre | a 15'52" | Francia | Bouygues Telecom |
| 127 | Angelo Furlan | a 16'13" | Italia | Crédit Agricole |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 140 | Ricardo Manuel Rodrigues Martins | a 4'40" | Portogallo | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 1 | Manuel Antonio Leal Cardoso | in 3h14'40" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 2 | Javier Benitez Pomares | st | Spagna | Benfica |
| 3 | Andreas Klöden | st | Germania | Astana |
| 4 | Sébastien Hinault | st | Francia | Crédit Agricole |
| 5 | Mikhaylo Khalilov | st | Ucraina | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 6 | Mikel Gaztañaga Echevarria | st | Spagna | Agritubel |
| 7 | Nuno Duarte Silva Marta | st | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 8 | David Blanco Rodríguez | st | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 9 | Jeremy Hunt | st | Canada | Crédit Agricole |
| 10 | Gustavo César Veloso | st | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 11 | Héctor Guerra García | st | Spagna | Liberty Seguros |
| 12 | Leonardo Fabio Duque | st | Colombia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 13 | Francesco Bellotti | st | Italia | Barloworld |
| 14 | Bruno Neves | st | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 15 | Francisco José Pacheco Torres | st | Spagna | Barbot - Siper |
| 16 | Tiago Jose Pinto Machado | st | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 17 | Martin Garrido Mayorga | st | Argentina | Palmeiras Resort - Tavira |
| 18 | Helder Oliveira | st | Portogallo | Barbot - Siper |
| 19 | Francisco Mancebo Pérez | st | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 20 | Hugo Sabido | st | Portogallo | Barloworld |
| 21 | Damien Monier | st | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 22 | Pedro Miguel Miranda Soeiro | st | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 23 | Maurizio Francesco Biondo | st | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 24 | Volker Ordowski | st | Germania | Gerolsteiner |
| 25 | Anthony Ravard | st | Francia | Agritubel |
| 26 | Arnaud Labbe | st | Francia | Bouygues Telecom |
| 27 | Eduard Vorganov | st | Russia | Xacobeo Galicia |
| 28 | Micael Isidoro | st | Portogallo | Fercase - Rota dos Móveis |
| 29 | Hugo Manuel Vitor Izidoro | st | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
