•••••
| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 71 | Adriano Angeloni | a 2'56" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 134 | Alejandro Magallanes Fernández | a 17'12" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 19 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 1'14" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 130 | Alejandro Paleo | a 16'48" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 110 | Alexandre Candido Oliveira | a 4'49" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 39 | Alexis Rodríguez Hernández | a 2'02" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 136 | André Moreira Vital | a 17'57" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 3 | Andreas Klöden | a 15" | Germania | Astana |
| 29 | Andrey Mizurov | a 1'38" | Kazakistan | Astana |
| 30 | Ángel Vicioso Arcos | a 1'39" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 127 | Angelo Furlan | a 16'13" | Italia | Crédit Agricole |
| 133 | Anthony Ravard | a 17'05" | Francia | Agritubel |
| 77 | Antonio Cosme Fraile | a 3'17" | Spagna | Madeinox Boavista |
| 40 | Antonio D'Aniello | a 2'03" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 117 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 5'36" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 37 | Arnaud Labbe | a 2'00" | Francia | Bouygues Telecom |
| 99 | Aurélien Clerc | a 4'02" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 51 | Benoît Joachim | a 2'22" | Lussemburgo | Astana |
| 91 | Benoît Salmon | a 3'45" | Francia | Agritubel |
| 128 | Bruno Antero Lima | a 16'24" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 42 | Bruno Manuel Silva Pires | a 2'04" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 109 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 4'35" | Portogallo | Benfica |
| 54 | Bruno Neves | a 2'27" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 96 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 3'59" | Portogallo | Benfica |
| 97 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 3'59" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 70 | Carlos Nozal Vega | a 2'51" | Spagna | Liberty Seguros |
| 55 | Cedric Coutouly | a 2'28" | Francia | Agritubel |
| 64 | César Antunes Quiterio | a 2'43" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 6 | Christopher Froome | a 25" | Kenya | Barloworld |
| 140 | Claudio Filipe Pedro Apolo | a 25'11" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 132 | Adriano Angeloni | st | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 82 | Alejandro Magallanes Fernández | st | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 32 | Alejandro Manuel Marque Porto | st | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 70 | Alejandro Paleo | st | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 64 | Alexandre Candido Oliveira | st | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 45 | Alexis Rodríguez Hernández | st | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 80 | André Moreira Vital | st | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 3 | Andreas Klöden | st | Germania | Astana |
| 122 | Andrey Mizurov | st | Kazakistan | Astana |
| 55 | Ángel Vicioso Arcos | st | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 125 | Angelo Furlan | st | Italia | Crédit Agricole |
| 25 | Anthony Ravard | st | Francia | Agritubel |
| 73 | Antonio Cosme Fraile | st | Spagna | Madeinox Boavista |
| 133 | Antonio D'Aniello | st | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 118 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | st | Portogallo | Barbot - Siper |
| 26 | Arnaud Labbe | st | Francia | Bouygues Telecom |
| 63 | Aurélien Clerc | st | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 69 | Benoît Joachim | st | Lussemburgo | Astana |
| 97 | Benoît Salmon | st | Francia | Agritubel |
| 72 | Bruno Antero Lima | st | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 71 | Bruno Manuel Silva Pires | st | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 111 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | st | Portogallo | Benfica |
| 14 | Bruno Neves | st | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 31 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | st | Portogallo | Benfica |
| 75 | Carlos Manuel Pinho Olivera | st | Portogallo | Barbot - Siper |
| 99 | Carlos Nozal Vega | st | Spagna | Liberty Seguros |
| 78 | Cedric Coutouly | st | Francia | Agritubel |
| 58 | César Antunes Quiterio | st | Portogallo | Liberty Seguros |
| 47 | Christopher Froome | st | Kenya | Barloworld |
| 114 | Claudio Filipe Pedro Apolo | st | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
