•••••
| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 91 | Renato Silva | a 1'03" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 92 | Aurélien Clerc | a 1'03" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 93 | Filipe Duarte Sousa Cardoso | a 1'04" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 94 | Francesco Bellotti | a 1'04" | Italia | Barloworld |
| 95 | Gabriel Rasch | a 1'08" | Norvegia | Crédit Agricole |
| 96 | Steven Kruijswijk | a 1'08" | Olanda | Rabobank #Continental |
| 97 | Mark Renshaw | a 1'08" | Australia | Crédit Agricole |
| 98 | Jose Carlos Silva Rodrigues | a 1'08" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 99 | Mario Jorge Faria da Costa | a 1'12" | Portogallo | Benfica |
| 100 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 1'12" | Portogallo | Benfica |
| 101 | Rui Alberto Faria da Costa | a 1'12" | Portogallo | Benfica |
| 102 | Dimitri Champion | a 1'12" | Francia | Bouygues Telecom |
| 103 | Luis Filipe Albino Silva | a 1'12" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 104 | Yohann Gène | a 1'12" | Francia | Bouygues Telecom |
| 105 | Alexandre Candido Oliveira | a 1'14" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 106 | Cédric Herve | a 1'18" | Francia | Agritubel |
| 107 | Moisés Dueñas Nevado | a 1'30" | Spagna | Barloworld |
| 108 | Marcel Beima | a 1'30" | Olanda | Rabobank #Continental |
| 109 | Luis Bartolomeu | a 1'30" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 110 | Serafín Martínez | a 1'30" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 111 | Gustavo Rodríguez Iglesias | a 1'46" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 112 | Vladimir Isaichev | a 1'47" | Russia | Xacobeo Galicia |
| 113 | Eric Berthou | a 1'49" | Francia | Crédit Agricole |
| 114 | Emilien-Benoît Berges | a 1'54" | Francia | Agritubel |
| 115 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 1'57" | Portogallo | Benfica |
| 5 | Bruno Neves | a 10" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 124 | Angelo Furlan | a 14'02" | Italia | Crédit Agricole |
| 125 | Laurent Lefèvre | a 14'02" | Francia | Bouygues Telecom |
| 126 | Maryan Hary | a 14'02" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 127 | Ricardo Horta | a 14'02" | Portogallo | Barbot - Siper |
•••••
| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 100 | Mario Jorge Faria da Costa | a 1'02" | Portogallo | Benfica |
| 101 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 1'02" | Portogallo | Benfica |
| 102 | Rui Alberto Faria da Costa | a 1'02" | Portogallo | Benfica |
| 103 | Dimitri Champion | a 1'02" | Francia | Bouygues Telecom |
| 104 | Luis Filipe Albino Silva | a 1'02" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 105 | Yohann Gène | a 1'02" | Francia | Bouygues Telecom |
| 106 | Cédric Herve | a 1'08" | Francia | Agritubel |
| 107 | Moisés Dueñas Nevado | a 1'20" | Spagna | Barloworld |
| 108 | Marcel Beima | a 1'20" | Olanda | Rabobank #Continental |
| 109 | Luis Bartolomeu | a 1'20" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 110 | Serafín Martínez | a 1'20" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 111 | Gustavo Rodríguez Iglesias | a 1'36" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 112 | Eric Berthou | a 1'39" | Francia | Crédit Agricole |
| 113 | Vladimir Isaichev | a 1'40" | Russia | Xacobeo Galicia |
| 114 | Emilien-Benoît Berges | a 1'44" | Francia | Agritubel |
| 115 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 1'47" | Portogallo | Benfica |
| 116 | Adriano Angeloni | a 1'52" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 124 | Angelo Furlan | a 13'52" | Italia | Crédit Agricole |
| 125 | Laurent Lefèvre | a 13'52" | Francia | Bouygues Telecom |
| 126 | Maryan Hary | a 13'52" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 127 | Ricardo Horta | a 13'52" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 128 | Alejandro Paleo | a 13'52" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 129 | Bruno Antero Lima | a 13'52" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 130 | Alejandro Magallanes Fernández | a 13'52" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 131 | Stéphane Augé | a 13'52" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 132 | Delio Fernández Cruz | a 13'52" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 133 | Helder Antonio Duarte Miranda | a 13'52" | Portogallo | Benfica |
| 134 | José Manuel Cuesta Valero | a 13'52" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 135 | André Moreira Vital | a 13'52" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 136 | Vidal Celis Zabala | a 13'52" | Spagna | Barbot - Siper |
