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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 116 | Adriano Angeloni | a 2'02" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 130 | Alejandro Magallanes Fernández | a 14'02" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 20 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 19" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 128 | Alejandro Paleo | a 14'02" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 105 | Alexandre Candido Oliveira | a 1'14" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 28 | Alexis Rodríguez Hernández | a 19" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 135 | André Moreira Vital | a 14'02" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 9 | Andreas Klöden | a 16" | Germania | Astana |
| 71 | Andrey Mizurov | a 45" | Kazakistan | Astana |
| 13 | Ángel Vicioso Arcos | a 17" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 124 | Angelo Furlan | a 14'02" | Italia | Crédit Agricole |
| 140 | Anthony Ravard | a 14'02" | Francia | Agritubel |
| 27 | Antonio Cosme Fraile | a 19" | Spagna | Madeinox Boavista |
| 65 | Antonio D'Aniello | a 19" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 83 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 48" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 62 | Arnaud Labbe | a 19" | Francia | Bouygues Telecom |
| 92 | Aurélien Clerc | a 1'03" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 84 | Benoît Joachim | a 48" | Lussemburgo | Astana |
| 46 | Benoît Salmon | a 19" | Francia | Agritubel |
| 129 | Bruno Antero Lima | a 14'02" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 35 | Bruno Manuel Silva Pires | a 19" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 115 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 1'57" | Portogallo | Benfica |
| 5 | Bruno Neves | a 10" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 100 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 1'12" | Portogallo | Benfica |
| 45 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 19" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 69 | Carlos Nozal Vega | a 40" | Spagna | Liberty Seguros |
| 66 | Cedric Coutouly | a 40" | Francia | Agritubel |
| 106 | Cédric Herve | a 1'18" | Francia | Agritubel |
| 57 | César Antunes Quiterio | a 19" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 59 | Christopher Froome | a 19" | Kenya | Barloworld |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 116 | Adriano Angeloni | a 1'52" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 130 | Alejandro Magallanes Fernández | a 13'52" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 16 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 9" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 128 | Alejandro Paleo | a 13'52" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 95 | Alexandre Candido Oliveira | a 54" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 24 | Alexis Rodríguez Hernández | a 9" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 135 | André Moreira Vital | a 13'52" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 8 | Andreas Klöden | a 6" | Germania | Astana |
| 71 | Andrey Mizurov | a 35" | Kazakistan | Astana |
| 32 | Ángel Vicioso Arcos | a 9" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 124 | Angelo Furlan | a 13'52" | Italia | Crédit Agricole |
| 140 | Anthony Ravard | a 13'52" | Francia | Agritubel |
| 23 | Antonio Cosme Fraile | a 9" | Spagna | Madeinox Boavista |
| 65 | Antonio D'Aniello | a 9" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 84 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 38" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 62 | Arnaud Labbe | a 9" | Francia | Bouygues Telecom |
| 92 | Aurélien Clerc | a 53" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 85 | Benoît Joachim | a 38" | Lussemburgo | Astana |
| 46 | Benoît Salmon | a 9" | Francia | Agritubel |
| 129 | Bruno Antero Lima | a 13'52" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 33 | Bruno Manuel Silva Pires | a 9" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 115 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 1'47" | Portogallo | Benfica |
| 4 | Bruno Neves | a 2" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 101 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 1'02" | Portogallo | Benfica |
| 44 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 9" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 69 | Carlos Nozal Vega | a 30" | Spagna | Liberty Seguros |
| 66 | Cedric Coutouly | a 30" | Francia | Agritubel |
| 106 | Cédric Herve | a 1'08" | Francia | Agritubel |
| 57 | César Antunes Quiterio | a 9" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 59 | Christopher Froome | a 9" | Kenya | Barloworld |
