| 1 | Alberto Contador Velasco | in 3h54'17" | Spagna | Astana | 
 | 2 | Juan Mauricio Soler Hernández | a 11" | Colombia | Barloworld | 
 | 3 | Thomas Dekker | a 33" | Olanda | Rabobank | 
 | 4 | Sergio Pardilla Bellón | a 33" | Spagna | Burgos Monumental | 
 | 5 | Denis Menchov | a 33" | Russia | Rabobank | 
 | 6 | Bauke Mollema | a 43" | Olanda | Rabobank | 
 | 7 | Chris Anker Sørensen | a 49" | Danimarca | Team CSC | 
 | 8 | David De la Fuente Rasilla | a 59" | Spagna | Saunier Duval - Scott | 
 | 9 | Danail Andonov Petrov | a 1'03" | Bulgaria | Benfica | 
 | 10 | José Humberto Rujano Guillén | a 1'05" | Venezuela | Caisse d'Epargne | 
 | 11 | Levi Leipheimer | a 1'05" | Usa | Astana | 
 | 12 | Julián Sánchez Pimienta | a 1'09" | Spagna | Contentpolis Murcia | 
 | 13 | Alberto Rodríguez Oliver | a 1'12" | Spagna | Contentpolis Murcia | 
 | 14 | Moisés Dueñas Nevado | a 1'12" | Spagna | Barloworld | 
 | 15 | Ezequiel Mosquera Miguez | a 1'14" | Spagna | Xacobeo Galicia | 
 | 16 | Rubén Lobato Elvira | a 1'14" | Spagna | Saunier Duval - Scott | 
 | 17 | Leonardo Moser | a 1'29" | Italia | Serramenti PVC Diquigiovanni - Androni Giocattoli | 
 | 18 | Christian Vande Velde | a 1'33" | Usa | Slipstream Chipotle presented by H30 | 
 | 19 | José Bento Carvalho de Azevedo | a 1'33" | Portogallo | Benfica | 
 | 20 | Francisco Pérez Sánchez | a 1'33" | Spagna | Caisse d'Epargne | 
 | 21 | Jaume Rovira Pous | a 1'33" | Spagna | Extremadura | 
 | 22 | José Antonio Redondo Ramos | a 1'36" | Spagna | Andalucía - Cajasur | 
 | 23 | Mikel Nieve Ituralde | a 1'38" | Spagna | Orbea - Oreka S.D.A. | 
 | 24 | Jose João Pimenta Costa Mendes | a 1'44" | Portogallo | Benfica | 
 | 25 | José Luis Carrasco Gamiz | a 1'46" | Spagna | Andalucía - Cajasur | 
 | 26 | Francesco Bellotti | a 1'56" | Italia | Barloworld | 
 | 27 | Amets Txurruka Ansola | a 1'56" | Spagna | Euskaltel - Euskadi | 
 | 28 | Alberto Fernández De La Puebla Ramos | a 1'56" | Spagna | Saunier Duval - Scott | 
 | 29 | Mauricio Alberto Ardila Cano | a 1'56" | Colombia | Rabobank | 
 | 30 | Koos Moerenhout | a 1'56" | Olanda | Rabobank |