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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Junya Sano | in 5h41'49" | Giappone | |
| 2 | Kazuo Inoue | a 10" | Giappone | Bridgestone Anchor Cycling Team |
| 3 | Genki Yamamoto | a 15" | Giappone | Vini Fantini - Nippo - De Rosa |
| 4 | Miyataka Shimizu | a 45" | Giappone | Bridgestone Anchor Cycling Team |
| 5 | Yukihiro Doi | a 1'02" | Giappone | Team Ukyo |
| 6 | Shotaro Iribe | a 1'02" | Giappone | Shimano Racing Team |
| 7 | Yusuke Hatanaka | a 1'02" | Giappone | Shimano Racing Team |
| 8 | Nariyuki Masuda | a 1'04" | Giappone | Utsunomiya - Blitzen |
| 9 | Fumiyuki Beppu | a 1'09" | Giappone | Trek Factory Team |
| 10 | Tomohiro Hayakawa | a 1'20" | Giappone | Aisan Racing Team |
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