Mikel Astarloza, 69° di tappa a 0" da Cavendish e 11° nella generale a 14'44" da Contador, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
•••••
Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 31 | Peter Velits | a 46'35" | Slovacchia | Team Milram |
| 32 | Hubert Dupont | a 49'43" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 33 | Chris Anker Sørensen | a 49'47" | Danimarca | Team Saxo Bank |
| 34 | Sergio Miguel Moreira Paulinho | a 54'00" | Portogallo | Astana |
| 35 | Tony Martin | a 55'04" | Germania | Team Columbia - High Road |
| 36 | Franco Pellizotti | a 56'19" | Italia | Liquigas |
| 37 | Sébastien Minard | a 57'37" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 38 | Luis Pasamontes Rodríguez | a 57'47" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 39 | Serguei Ivanov | a 1h00'21" | Russia | Team Katusha |
| 40 | Yaroslav Popovych | a 1h01'08" | Ucraina | Astana |
| 41 | Laurent Lefèvre | a 1h01'29" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 42 | Rémi Pauriol | a 1h03'04" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 43 | Egoi Martínez de Esteban | a 1h07'20" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 44 | Volodymir Gustov | a 1h08'15" | Ucraina | Cervélo Test Team |
| 45 | Matthew Lloyd | a 1h09'05" | Australia | Silence - Lotto |
| 46 | Yury Trofimov | a 1h09'23" | Russia | Bbox Bouygues Telecom |
| 47 | Jérémy Roy | a 1h09'23" | Francia | Française des Jeux |
| 48 | Ryder Hesjedal | a 1h14'03" | Canada | Garmin - Slipstream |
| 49 | Gustav Erik Larsson | a 1h15'22" | Svezia | Team Saxo Bank |
| 50 | Denis Menchov | a 1h17'04" | Russia | Rabobank |
| 51 | Rigoberto Urán Urán | a 1h20'20" | Colombia | Caisse d'Epargne |
| 52 | David Loosli | a 1h21'56" | Svizzera | Lampre - N.G.C. |
| 53 | Grischa Niermann | a 1h21'59" | Germania | Rabobank |
| 54 | Sylvain Calzati | a 1h25'47" | Francia | Agritubel |
| 55 | Pierrick Fédrigo | a 1h26'07" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 56 | Kim Kirchen | a 1h26'52" | Lussemburgo | Team Columbia - High Road |
| 57 | David Moncoutié | a 1h28'35" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 58 | Charles Wegelius | a 1h29'37" | Finlandia | Silence - Lotto |
| 59 | Laurens Ten Dam | a 1h34'57" | Olanda | Rabobank |
| 60 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 1h35'49" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
•••••
| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 31 | Johan Vansummeren | st | Belgio | Silence - Lotto |
| 32 | Aliaksandr Kuchynski | st | Bielorussia | Liquigas |
| 33 | Rubén Pérez Moreno | st | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 34 | Juan Antonio Flecha Giannoni | st | Argentina | Rabobank |
| 35 | Greg Van Avermaet | st | Belgio | Silence - Lotto |
| 36 | Stijn Vandenbergh | st | Belgio | Team Katusha |
| 37 | Óscar Freire Gómez | st | Spagna | Rabobank |
| 38 | Rinaldo Nocentini | st | Italia | AG2R La Mondiale |
| 39 | Vincenzo Nibali | st | Italia | Liquigas |
| 40 | Christophe Le Mével | st | Francia | Française des Jeux |
| 41 | Julian Dean | st | Nuova Zelanda | Garmin - Slipstream |
| 42 | Heinrich Haussler | st | Australia | Cervélo Test Team |
| 43 | Serguei Ivanov | st | Russia | Team Katusha |
| 44 | Christian Vande Velde | st | Usa | Garmin - Slipstream |
| 45 | Christian Knees | st | Germania | Team Milram |
| 46 | Alessandro Vanotti | st | Italia | Liquigas |
| 47 | Alexandre Botcharov | st | Russia | Team Katusha |
| 48 | Jérôme Pineau | st | Francia | Quick Step |
| 49 | Christophe Moreau | st | Francia | Agritubel |
| 50 | Alessandro Ballan | st | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 51 | Mickaël Delage | st | Francia | Silence - Lotto |
| 52 | Stijn Devolder | st | Belgio | Quick Step |
| 53 | Frederik Willems | st | Belgio | Liquigas |
| 54 | Roman Kreuziger | st | Repubblica Ceca | Liquigas |
| 55 | Bradley Wiggins | st | Belgio | Garmin - Slipstream |
| 56 | Fränk Schleck | st | Lussemburgo | Team Saxo Bank |
| 57 | Sébastien Minard | st | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 58 | Daniele Righi | st | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 59 | Cadel Evans | st | Australia | Silence - Lotto |
| 60 | Jérémy Roy | st | Francia | Française des Jeux |
