| 1 | Stijn Devolder | in 35'33" | Belgio | Quick Step |
| 2 | Sylvain Chavanel | a 22" | Francia | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 3 | Héctor Guerra García | a 33" | Spagna | Liberty Seguros |
| 4 | Tomas Vaitkus | a 48" | Lituania | Astana |
| 5 | Martin Garrido Mayorga | a 1'03" | Argentina | Palmeiras Resort - Tavira |
| 6 | Pedro Romero Ocampo | a 1'06" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 7 | Andreas Klöden | a 1'07" | Germania | Astana |
| 8 | Jürgen Roelandts | a 1'11" | Belgio | Silence - Lotto |
| 9 | Rubén Plaza Molina | a 1'13" | Spagna | Benfica |
| 10 | Markus Fothen | a 1'18" | Germania | Gerolsteiner |
| 11 | Bert Grabsch | a 1'23" | Germania | High Road |
| 12 | David Blanco Rodríguez | a 1'31" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 13 | Jos Van Emden | a 1'31" | Olanda | Rabobank |
| 14 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 1'41" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 15 | Sebastian Lang | a 1'48" | Germania | Gerolsteiner |
| 16 | Tiago Jose Pinto Machado | a 1'49" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 17 | Tejay Van Garderen | a 2'01" | Usa | Rabobank #Continental |
| 18 | Michael Schär | a 2'02" | Svizzera | Astana |
| 19 | Hugo Sabido | a 2'04" | Portogallo | Barloworld |
| 20 | Rik Verbrugghe | a 2'07" | Belgio | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 21 | Christian Pfannberger | a 2'18" | Austria | Barloworld |
| 22 | Björn Schröder | a 2'20" | Germania | Team Milram |
| 23 | Mauro Facci | a 2'22" | Italia | Quick Step |
| 24 | Kevin De Weert | a 2'31" | Belgio | Cofidis, le Crédit par Télephone |
| 25 | Diego Caccia | a 2'32" | Italia | Barloworld |
| 26 | Isidro Nozal Vega | a 2'34" | Spagna | Liberty Seguros |
| 27 | Francisco Mancebo Pérez | a 2'35" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 28 | Claudio Filipe Pedro Apolo | a 2'36" | Portogallo | Palmeiras Resort - Tavira |
| 29 | Sergio Miguel Moreira Paulinho | a 2'44" | Portogallo | Astana |
| 30 | Daryl Impey | a 2'46" | Sudafrica | Barloworld |