| 31 | Cayetano José Sarmiento Tunarrosa | a 1'52" | Colombia | Acqua & Sapone |
| 32 | Sander Armée | a 1'53" | Belgio | Topsport Vlaanderen - Mercator |
| 33 | Héctor Leonardo Paez León | a 1'54" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 34 | Vladimir Karpets | a 1'57" | Russia | Katusha Team |
| 35 | Alberto Losada Alguacil | a 2'00" | Spagna | Katusha Team |
| 36 | Lluís Guillermo Mas Bonet | a 2'08" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 37 | Víctor Cabedo | a 2'20" | Spagna | Orbea Continental |
| 38 | Juan José Oroz Ugalde | a 2'26" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 39 | Jesús Rosendo Prado | a 2'28" | Spagna | Andalucía Caja Granada |
| 40 | Yukihiro Doi | a 2'29" | Giappone | Skil - Shimano |
| 41 | Iñigo Cuesta López De Castro | a 2'39" | Spagna | Caja Rural |
| 42 | Johan Coenen | a 2'39" | Belgio | Topsport Vlaanderen - Mercator |
| 43 | David De la Fuente Rasilla | a 2'39" | Spagna | Geox - TMC |
| 44 | Mauricio Alberto Ardila Cano | a 2'40" | Colombia | Geox - TMC |
| 45 | Luca Solari | a 2'41" | Italia | Androni Giocattoli - C.I.P.I. |
| 46 | Camilo Andrés Suárez Albarracín | a 2'45" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 47 | Jérôme Baugnies | a 2'50" | Belgio | Topsport Vlaanderen - Mercator |
| 48 | Joan Horrach Rippoll | a 2'53" | Spagna | Katusha Team |
| 49 | Alex Norberto Cano Ardila | a 2'53" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 50 | Antonio Santoro | a 2'55" | Italia | Androni Giocattoli - C.I.P.I. |
| 51 | Rafael Valls Ferri | a 3'02" | Spagna | Geox - TMC |
| 52 | Francesco Di Paolo | a 3'07" | Italia | Acqua & Sapone |
| 53 | Ramón Domene Reyes | a 3'07" | Spagna | |
| 54 | Tobias Ludvigsson | a 3'14" | Svezia | Team CykelCity |
| 55 | Geert Steurs | a 3'19" | Belgio | Topsport Vlaanderen - Mercator |
| 56 | Luca Barla | a 3'20" | Italia | Androni Giocattoli - C.I.P.I. |
| 57 | Christopher Jennings | a 3'22" | Sudafrica | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 58 | Jesús Herrada López | a 3'25" | Spagna | Movistar Team |
| 59 | Javier Moreno Bazán | a 3'26" | Spagna | Caja Rural |
| 60 | Vladimir Miholjevic | a 3'34" | Croazia | Acqua & Sapone |