| 61 | Juan Mauricio Soler Hernández | a 1'19" | Colombia | Movistar Team |
| 62 | Jesús Hernández Blázquez | a 1'20" | Spagna | Saxo Bank SunGard |
| 63 | José Alberto Benítez Román | a 1'21" | Spagna | Andalucía Caja Granada |
| 64 | Jorge Azanza Soto | a 1'21" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 65 | John Edibberto Martínez Montero | a 1'24" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 66 | Manuel Belletti | a 1'24" | Italia | Colnago - CSF Inox |
| 67 | Daniel Sesma | a 1'24" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 68 | Darwin Atapuma Hurtado | a 1'25" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 69 | Julien Simon | a 1'27" | Francia | Saur - Sojasun |
| 70 | Guillaume Levarlet | a 1'27" | Francia | Saur - Sojasun |
| 71 | Aritz Etxebarria Etxebarria | a 1'27" | Spagna | Orbea Continental |
| 72 | Vicente David Bernabéu Armengol | a 1'31" | Spagna | Andalucía Caja Granada |
| 73 | Francisco Manuel Anton Marin | a 1'32" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 74 | Mikel Nieve Ituralde | a 1'32" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 75 | Marko Kump | a 1'34" | Slovenia | Geox - TMC |
| 76 | Juan José Lobato del Valle | a 1'35" | Spagna | Andalucía Caja Granada |
| 77 | Raul Alarcon García | a 1'36" | Spagna | Barbot - Efapel |
| 78 | Rubén Martínez Hernández | a 1'38" | Spagna | Caja Rural |
| 79 | Matthias Brändle | a 1'38" | Austria | Geox - TMC |
| 80 | Jacques Janse Van Rensburg | a 1'40" | Sudafrica | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 81 | Walter Fernando Pedraza Morales | a 1'40" | Colombia | EPM - UNE |
| 82 | Benjamin Noval González | a 1'42" | Spagna | Saxo Bank SunGard |
| 83 | Filipe Duarte Sousa Cardoso | a 1'45" | Portogallo | Barbot - Efapel |
| 84 | Pierre Cazaux | a 1'46" | Francia | Euskaltel - Euskadi |
| 85 | David Gutiérrez Gutiérrez | a 1'47" | Spagna | Geox - TMC |
| 86 | Mikel Bizkarra | a 1'49" | Spagna | Orbea Continental |
| 87 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 1'50" | Portogallo | Barbot - Efapel |
| 88 | Gianluca Brambilla | a 1'50" | Italia | Colnago - CSF Inox |
| 89 | Javier Aramendia Llorente | a 1'52" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 90 | Ben Swift | a 1'53" | Gran Bretagna | Sky ProCycling |