| 31 | Héctor Leonardo Paez León | a 5'03" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 32 | Stefano Pirazzi | a 5'10" | Italia | Colnago - CSF Inox |
| 33 | Javier Aramendia Llorente | a 5'14" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 34 | Pablo Lastras García | a 5'15" | Spagna | Movistar Team |
| 35 | Walter Fernando Pedraza Morales | a 5'41" | Colombia | EPM - UNE |
| 36 | Víctor Cabedo | a 6'50" | Spagna | Orbea Continental |
| 37 | Rafael Infantino Abreu | a 7'42" | Colombia | EPM - UNE |
| 38 | Sergio Miguel Vieira Ribeiro | a 8'46" | Portogallo | Barbot - Efapel |
| 39 | Mikel Bizkarra | a 9'03" | Spagna | Orbea Continental |
| 40 | Victor Hugo Peña Grisales | a 9'49" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 41 | Alex Norberto Cano Ardila | a 10'04" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 42 | José Alberto Benítez Román | a 10'20" | Spagna | Andalucía Caja Granada |
| 43 | Camilo Andrés Suárez Albarracín | a 10'33" | Colombia | Colombia Es Pasión - Café de Colombia |
| 44 | Egoitz García Etxeguibel | a 11'59" | Spagna | Caja Rural |
| 45 | Russell Downing | a 12'00" | Gran Bretagna | Sky ProCycling |
| 46 | Carlos Ivan Oyarzun Guiñez | a 12'05" | Cile | Movistar Team |
| 47 | Federico Canuti | a 12'09" | Italia | Colnago - CSF Inox |
| 48 | David De La Cruz Melgarejo | a 12'13" | Spagna | Caja Rural |
| 49 | Rubén Pérez Moreno | a 12'13" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 50 | Carlos Sastre Candil | a 12'14" | Spagna | Geox - TMC |
| 51 | Ludovic Turpin | a 12'15" | Francia | Saur - Sojasun |
| 52 | Peter Kennaugh | a 12'15" | Gran Bretagna | Sky ProCycling |
| 53 | Carlos Verona Quintanilla | a 12'28" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 54 | Fabricio Ferrari Barcelo | a 12'31" | Uruguay | Caja Rural |
| 55 | Yannick Talabardon | a 12'34" | Francia | Saur - Sojasun |
| 56 | Matthias Brändle | a 12'54" | Austria | Geox - TMC |
| 57 | Jacques Janse Van Rensburg | a 12'56" | Sudafrica | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 58 | Diego Gallego Arnaiz | a 13'36" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 59 | Daniel Navarro García | a 13'38" | Spagna | Saxo Bank SunGard |
| 60 | José Luis Roldan Carmona | a 13'45" | Spagna | Andalucía Caja Granada |