| 31 | Didac Ortega | a 1'04" | Spagna | Acqua & Sapone - D'Angelo & Antenucci |
| 32 | Alexandre Botcharov | a 1'06" | Russia | Team Katusha |
| 33 | Serguei Klimov | a 1'10" | Russia | Team Katusha |
| 34 | Preben Van Hecke | a 1'14" | Belgio | Topsport Vlaanderen - Mercator |
| 35 | Mauro Facci | a 1'19" | Italia | Quick Step |
| 36 | Serafín Martínez | a 1'22" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 37 | Joan Horrach Rippoll | a 1'29" | Spagna | Team Katusha |
| 38 | Marco Liquori | a 1'33" | Italia | Petroli Firenze - Cycling Team [Dilettanti] |
| 39 | Ivan Santaromita | a 1'39" | Italia | Liquigas - Doimo |
| 40 | Johnnie Walker | a 1'40" | Australia | Footon - Servetto |
| 41 | Ivan Melero Coco | a 1'46" | Spagna | Burgos 2016 - Castilla y León |
| 42 | Ion Izagirre Insausti | a 1'52" | Spagna | Orbea |
| 43 | Romain Feillu | a 1'59" | Francia | Vacansoleil Pro Cycling Team |
| 44 | Mikel Landa Meana | a 1'59" | Spagna | Orbea |
| 45 | Luca Celli | a 2'06" | Italia | Ceramica Flaminia |
| 46 | Mauricio Alberto Ardila Cano | a 2'12" | Colombia | Rabobank |
| 47 | Enrique Mata | a 2'13" | Spagna | Footon - Servetto |
| 48 | Manuel Ortega Ocaña | a 2'16" | Spagna | Andalucía - Cajasur |
| 49 | Frederik Veuchelen | a 2'18" | Belgio | Vacansoleil Pro Cycling Team |
| 50 | Vladimir Miholjevic | a 2'19" | Croazia | Acqua & Sapone - D'Angelo & Antenucci |
| 51 | Stéphane Rossetto | a 2'26" | Francia | Vacansoleil Pro Cycling Team |
| 52 | Wouter Poels | a 2'32" | Olanda | Vacansoleil Pro Cycling Team |
| 53 | Sergio Carrasco García | a 2'52" | Spagna | Andalucía - Cajasur |
| 54 | David Gutiérrez Gutiérrez | a 2'53" | Spagna | Footon - Servetto |
| 55 | Addy Engels | a 3'06" | Olanda | Quick Step |
| 56 | Juan José Cobo Acebo | a 3'07" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 57 | Jorge Martin Montenegro | a 3'22" | Argentina | Andalucía - Cajasur |
| 58 | Javier Moreno Bazán | a 3'24" | Spagna | Andalucía - Cajasur |
| 59 | Stefano Garzelli | a 3'39" | Italia | Acqua & Sapone - D'Angelo & Antenucci |
| 60 | Davide Viganò | a 3'43" | Italia | Sky Professional Cycling Team |
