Mikel Astarloza, 18° di tappa a 6'12" da Schleck e 10° nella generale a 10'50" da Contador, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | David Zabriskie | a 1h17'20" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 62 | Igor Antón Hernández | a 1h17'36" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 63 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 1h18'18" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 64 | Amets Txurruka Ansola | a 1h20'21" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 65 | Thomas Voeckler | a 1h20'40" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 66 | David Arroyo Duran | a 1h21'16" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 67 | José Luis Arrieta Lujambio | a 1h23'09" | Spagna | AG2R La Mondiale |
| 68 | Juan Manuel Gárate Cepa | a 1h25'38" | Spagna | Rabobank |
| 69 | Nicolas Vogondy | a 1h25'52" | Francia | Agritubel |
| 70 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 1h27'09" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 71 | Maxime Bouet | a 1h28'58" | Francia | Agritubel |
| 72 | Geoffroy Lequatre | a 1h29'02" | Francia | Agritubel |
| 73 | Christophe Kern | a 1h29'33" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 74 | David Millar | a 1h29'57" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 75 | Amaël Moinard | a 1h31'02" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 76 | Marzio Bruseghin | a 1h32'04" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 77 | Rubén Pérez Moreno | a 1h32'20" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 78 | Johannes Fröhlinger | a 1h33'20" | Germania | Team Milram |
| 79 | Joost Posthuma | a 1h36'29" | Olanda | Rabobank |
| 80 | Iñigo Cuesta López De Castro | a 1h36'54" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 81 | Fabian Cancellara | a 1h40'08" | Svizzera | Team Saxo Bank |
| 82 | Stijn Devolder | a 1h41'32" | Belgio | Quick Step |
| 83 | Joan Horrach Rippoll | a 1h42'19" | Spagna | Team Katusha |
| 84 | José Joaquín Rojas Gil | a 1h42'37" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 85 | Leonardo Fabio Duque | a 1h45'52" | Colombia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 86 | Frederik Willems | a 1h45'56" | Belgio | Liquigas |
| 87 | Sebastian Lang | a 1h49'40" | Germania | Silence - Lotto |
| 88 | Heinrich Haussler | a 1h50'48" | Australia | Cervélo Test Team |
| 89 | Greg Van Avermaet | a 1h53'17" | Belgio | Silence - Lotto |
| 90 | Juan Antonio Flecha Giannoni | a 1h53'47" | Argentina | Rabobank |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | Juan Antonio Flecha Giannoni | a 21'31" | Argentina | Rabobank |
| 62 | Denis Menchov | a 21'31" | Russia | Rabobank |
| 63 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 25'38" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 64 | Filippo Pozzato | a 29'43" | Italia | Team Katusha |
| 65 | Alessandro Ballan | a 29'43" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 66 | Thierry Hupond | a 29'43" | Francia | Skil - Shimano |
| 67 | Koen De Kort | a 29'43" | Olanda | Skil - Shimano |
| 68 | José Joaquín Rojas Gil | a 29'43" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 69 | Stef Clement | a 29'43" | Olanda | Rabobank |
| 70 | Jérémy Roy | a 29'43" | Francia | Française des Jeux |
| 71 | Mauro Santambrogio | a 29'43" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 72 | Simon Spilak | a 29'43" | Slovenia | Lampre - N.G.C. |
| 73 | Maxime Bouet | a 29'43" | Francia | Agritubel |
| 74 | Alan Pérez Lezaun | a 29'43" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 75 | Juan José Oroz Ugalde | a 29'43" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 76 | Fumiyuki Beppu | a 29'43" | Giappone | Skil - Shimano |
| 77 | Heinrich Haussler | a 29'43" | Australia | Cervélo Test Team |
| 78 | Thor Hushovd | a 29'43" | Norvegia | Cervélo Test Team |
| 79 | Volodymir Gustov | a 29'43" | Ucraina | Cervélo Test Team |
| 80 | Cadel Evans | a 29'43" | Australia | Silence - Lotto |
| 81 | Brett Lancaster | a 29'43" | Australia | Cervélo Test Team |
| 82 | Staf Scheirlinckx | a 29'43" | Belgio | Silence - Lotto |
| 83 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 29'43" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 84 | Juan Manuel Gárate Cepa | a 29'43" | Spagna | Rabobank |
| 85 | Nikolay Trusov | a 29'43" | Russia | Team Katusha |
| 86 | Luis León Sánchez Gil | a 29'43" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 87 | Gustav Erik Larsson | a 29'43" | Svezia | Team Saxo Bank |
| 88 | Charles Wegelius | a 29'43" | Finlandia | Silence - Lotto |
| 89 | Geoffroy Lequatre | a 29'43" | Francia | Agritubel |
| 90 | Johannes Fröhlinger | a 29'43" | Germania | Team Milram |
