Mikel Astarloza, 21° di tappa a 2'41" da Contador e 19° nella generale a 5'37" da Contador, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 91 | José Luis Arrieta Lujambio | a 1h07'07" | Spagna | AG2R La Mondiale |
| 92 | Juan José Oroz Ugalde | a 1h08'49" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 93 | Joost Posthuma | a 1h08'58" | Olanda | Rabobank |
| 94 | Juan Antonio Flecha Giannoni | a 1h09'00" | Argentina | Rabobank |
| 95 | Joan Horrach Rippoll | a 1h09'40" | Spagna | Team Katusha |
| 96 | Johan Vansummeren | a 1h09'54" | Belgio | Silence - Lotto |
| 97 | Marzio Bruseghin | a 1h10'31" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 98 | Iñigo Cuesta López De Castro | a 1h12'27" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 99 | Óscar Freire Gómez | a 1h13'42" | Spagna | Rabobank |
| 100 | Filippo Pozzato | a 1h13'51" | Italia | Team Katusha |
| 101 | Greg Van Avermaet | a 1h13'51" | Belgio | Silence - Lotto |
| 102 | Aliaksandr Kuchynski | a 1h14'19" | Bielorussia | Liquigas |
| 103 | Bingen Fernández Bustinza | a 1h14'41" | Spagna | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 104 | Rubén Pérez Moreno | a 1h15'54" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 105 | Sébastien Rosseler | a 1h17'40" | Belgio | Quick Step |
| 106 | Jussi Veikkanen | a 1h18'03" | Finlandia | Française des Jeux |
| 107 | Thor Hushovd | a 1h22'38" | Norvegia | Cervélo Test Team |
| 108 | Leonardo Fabio Duque | a 1h24'19" | Colombia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 109 | Matteo Tosatto | a 1h25'19" | Italia | Quick Step |
| 110 | Markus Fothen | a 1h26'08" | Germania | Team Milram |
| 111 | Stuart O'Grady | a 1h26'29" | Australia | Team Saxo Bank |
| 112 | Michael Rogers | a 1h26'51" | Australia | Team Columbia - High Road |
| 113 | Alessandro Vanotti | a 1h30'57" | Italia | Liquigas |
| 114 | Brian Bach Vandborg | a 1h31'28" | Danimarca | Liquigas |
| 115 | Arnaud Coyot | a 1h32'03" | Francia | Caisse d'Epargne |
| 116 | Stijn Vandenbergh | a 1h32'44" | Belgio | Team Katusha |
| 117 | Nikolay Trusov | a 1h33'18" | Russia | Team Katusha |
| 118 | Koen De Kort | a 1h34'29" | Olanda | Skil - Shimano |
| 119 | Simon Spilak | a 1h35'29" | Slovenia | Lampre - N.G.C. |
| 120 | Stef Clement | a 1h36'19" | Olanda | Rabobank |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 91 | Amaël Moinard | a 12'11" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 92 | Egoi Martínez de Esteban | a 12'11" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 93 | Marzio Bruseghin | a 12'11" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 94 | Staf Scheirlinckx | a 12'11" | Belgio | Silence - Lotto |
| 95 | Alexandre Pichot | a 12'11" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 96 | David Moncoutié | a 12'11" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 97 | Franco Pellizotti | a 12'11" | Italia | Liquigas |
| 98 | Sebastian Lang | a 12'11" | Germania | Silence - Lotto |
| 99 | Michael Rogers | a 12'11" | Australia | Team Columbia - High Road |
| 100 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 12'11" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 101 | Johannes Fröhlinger | a 12'11" | Germania | Team Milram |
| 102 | David Millar | a 12'11" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 103 | David Zabriskie | a 12'11" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 104 | Jussi Veikkanen | a 12'11" | Finlandia | Française des Jeux |
| 105 | Fabian Wegmann | a 12'11" | Germania | Team Milram |
| 106 | Johan Vansummeren | a 12'11" | Belgio | Silence - Lotto |
| 107 | Greg Van Avermaet | a 12'11" | Belgio | Silence - Lotto |
| 108 | Alessandro Ballan | a 13'11" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 109 | Mauro Santambrogio | a 13'11" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 110 | Matteo Tosatto | a 13'11" | Italia | Quick Step |
| 111 | Sébastien Minard | a 13'15" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 112 | Bingen Fernández Bustinza | a 13'15" | Spagna | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 113 | Stuart O'Grady | a 13'15" | Australia | Team Saxo Bank |
| 114 | Danny Pate | a 13'15" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 115 | David Arroyo Duran | a 13'35" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 116 | Stef Clement | a 14'13" | Olanda | Rabobank |
| 117 | Juan Antonio Flecha Giannoni | a 14'13" | Argentina | Rabobank |
| 118 | Jonathan Hivert | a 14'15" | Francia | Skil - Shimano |
| 119 | Markus Fothen | a 14'15" | Germania | Team Milram |
| 120 | Niki Terpstra | a 14'46" | Olanda | Team Milram |
