Mikel Astarloza, 20° di tappa a 34" da Fedrigo e 17° nella generale a 3'02" da Nocentini, squalificato in seguito ad una positività all'EPO in un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | David Millar | a 27'18" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 62 | Christophe Moreau | a 27'58" | Francia | Agritubel |
| 63 | Thomas Voeckler | a 28'03" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 64 | José Joaquín Rojas Gil | a 28'07" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 65 | Geoffroy Lequatre | a 28'08" | Francia | Agritubel |
| 66 | Carlos Barredo Llamazales | a 29'01" | Spagna | Quick Step |
| 67 | Kurt-Asle Arvesen | a 29'48" | Norvegia | Team Saxo Bank |
| 68 | David Zabriskie | a 29'50" | Usa | Garmin - Slipstream |
| 69 | Ryder Hesjedal | a 31'28" | Canada | Garmin - Slipstream |
| 70 | Matthew Lloyd | a 31'57" | Australia | Silence - Lotto |
| 71 | José Luis Arrieta Lujambio | a 32'01" | Spagna | AG2R La Mondiale |
| 72 | Jérôme Pineau | a 32'44" | Francia | Quick Step |
| 73 | David Arroyo Duran | a 32'49" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 74 | Serguei Ivanov | a 33'23" | Russia | Team Katusha |
| 75 | Johannes Fröhlinger | a 33'28" | Germania | Team Milram |
| 76 | Juan José Oroz Ugalde | a 34'51" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 77 | Maxime Bouet | a 35'02" | Francia | Agritubel |
| 78 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 35'22" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 79 | Charles Wegelius | a 35'40" | Finlandia | Silence - Lotto |
| 80 | Alessandro Ballan | a 35'43" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 81 | Fabian Cancellara | a 36'11" | Svizzera | Team Saxo Bank |
| 82 | Frederik Willems | a 36'46" | Belgio | Liquigas |
| 83 | Juan Antonio Flecha Giannoni | a 37'52" | Argentina | Rabobank |
| 84 | Igor Antón Hernández | a 39'02" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 85 | Pierrick Fédrigo | a 39'43" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 86 | Cyril Dessel | a 39'54" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 87 | Rui Alberto Faria da Costa | a 41'25" | Portogallo | Caisse d'Epargne |
| 88 | Óscar Freire Gómez | a 41'58" | Spagna | Rabobank |
| 89 | Hayden Roulston | a 42'10" | Nuova Zelanda | Cervélo Test Team |
| 90 | Aliaksandr Kuchynski | a 42'35" | Bielorussia | Liquigas |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 61 | Gustav Erik Larsson | a 34" | Svezia | Team Saxo Bank |
| 62 | Carlos Barredo Llamazales | a 34" | Spagna | Quick Step |
| 63 | Matthew Lloyd | a 34" | Australia | Silence - Lotto |
| 64 | David Moncoutié | a 34" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 65 | Laurent Lefèvre | a 34" | Francia | Bbox Bouygues Telecom |
| 66 | David Millar | a 34" | Malta | Garmin - Slipstream |
| 67 | Sergio Miguel Moreira Paulinho | a 34" | Portogallo | Astana |
| 68 | Hubert Dupont | a 34" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 69 | Luis Pasamontes Rodríguez | a 34" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 70 | Yury Trofimov | a 34" | Russia | Bbox Bouygues Telecom |
| 71 | Juan Manuel Gárate Cepa | a 34" | Spagna | Rabobank |
| 72 | Nicolas Vogondy | a 34" | Francia | Agritubel |
| 73 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 34" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 74 | David Arroyo Duran | a 34" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 75 | Amaël Moinard | a 34" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 76 | Laurens Ten Dam | a 34" | Olanda | Rabobank |
| 77 | Grischa Niermann | a 1'19" | Germania | Rabobank |
| 78 | Rui Alberto Faria da Costa | a 1'32" | Portogallo | Caisse d'Epargne |
| 79 | Charles Wegelius | a 2'08" | Finlandia | Silence - Lotto |
| 80 | Martijn Maaskant | a 15'15" | Olanda | Garmin - Slipstream |
| 81 | Johan Vansummeren | a 15'15" | Belgio | Silence - Lotto |
| 82 | Mauro Santambrogio | a 15'15" | Italia | Lampre - N.G.C. |
| 83 | Joan Horrach Rippoll | a 15'15" | Spagna | Team Katusha |
| 84 | Juan José Oroz Ugalde | a 15'15" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 85 | Christophe Kern | a 18'48" | Francia | Cofidis, le Crédit en Ligne |
| 86 | Alessandro Vanotti | a 18'48" | Italia | Liquigas |
| 87 | Sebastian Lang | a 18'48" | Germania | Silence - Lotto |
| 88 | Joost Posthuma | a 18'48" | Olanda | Rabobank |
| 89 | Christophe Moreau | a 18'48" | Francia | Agritubel |
| 90 | Arnaud Coyot | a 18'48" | Francia | Caisse d'Epargne |
