Mikel Astarloza Chaurreau, 10° a 2'09" con l'Euskaltel-Euskadi, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito alla scoperta della positività all'EPO ad un controllo fuori dalle competizioni effettuato il 26 giugno 2009.
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Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 31 | Fabio Sabatini | a 2'50" | Italia | Liquigas |
| 32 | Bert Grabsch | a 2'51" | Germania | Team Columbia - High Road |
| 33 | Luis Pasamontes Rodríguez | a 2'56" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 34 | Cadel Evans | a 2'59" | Australia | Silence - Lotto |
| 35 | Serguei Ivanov | a 2'59" | Russia | Team Katusha |
| 36 | Thor Hushovd | a 2'59" | Norvegia | Cervélo Test Team |
| 37 | Stuart O'Grady | a 3'00" | Australia | Team Saxo Bank |
| 38 | Mikhail Ignatiev | a 3'02" | Russia | Team Katusha |
| 39 | Oscar Pereiro Sio | a 3'03" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 40 | Hayden Roulston | a 3'05" | Nuova Zelanda | Cervélo Test Team |
| 41 | Rui Alberto Faria da Costa | a 3'06" | Portogallo | Caisse d'Epargne |
| 42 | Heinrich Haussler | a 3'07" | Australia | Cervélo Test Team |
| 43 | Volodymir Gustov | a 3'09" | Ucraina | Cervélo Test Team |
| 44 | Linus Gerdemann | a 3'11" | Germania | Team Milram |
| 45 | Rigoberto Urán Urán | a 3'12" | Colombia | Caisse d'Epargne |
| 46 | Rinaldo Nocentini | a 3'13" | Italia | AG2R La Mondiale |
| 47 | Nicolas Roche | a 3'16" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 48 | Jérôme Pineau | a 3'17" | Francia | Quick Step |
| 49 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 3'17" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 50 | José Joaquín Rojas Gil | a 3'17" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 51 | Filippo Pozzato | a 3'18" | Italia | Team Katusha |
| 52 | Luis León Sánchez Gil | a 3'18" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 53 | Lloyd Mondory | a 3'21" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 54 | Sylvain Chavanel | a 3'23" | Francia | Quick Step |
| 55 | Juan José Oroz Ugalde | a 3'24" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 56 | Gorka Verdugo Marcotegui | a 3'25" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
| 57 | Brett Lancaster | a 3'28" | Australia | Cervélo Test Team |
| 58 | Frederik Willems | a 3'32" | Belgio | Liquigas |
| 59 | Mark Cavendish | a 3'33" | Gran Bretagna | Team Columbia - High Road |
| 60 | Stéphane Goubert | a 3'34" | Francia | AG2R La Mondiale |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 6 | Alexandre Botcharov | a 1'23" | Russia | Team Katusha |
| 6 | Mikhail Ignatiev | a 1'23" | Russia | Team Katusha |
| 6 | Serguei Ivanov | a 1'23" | Russia | Team Katusha |
| 6 | Filippo Pozzato | a 1'23" | Italia | Team Katusha |
| 6 | Nikolay Trusov | a 1'23" | Russia | Team Katusha |
| 7 | Oscar Pereiro Sio | a 1'29" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 7 | Rui Alberto Faria da Costa | a 1'29" | Portogallo | Caisse d'Epargne |
| 7 | José Ivan Gutiérrez Palacios | a 1'29" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 7 | Luis Pasamontes Rodríguez | a 1'29" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 7 | José Joaquín Rojas Gil | a 1'29" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 7 | Luis León Sánchez Gil | a 1'29" | Spagna | Caisse d'Epargne |
| 7 | Rigoberto Urán Urán | a 1'29" | Colombia | Caisse d'Epargne |
| 8 | Carlos Sastre Candil | a 1'37" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 8 | Iñigo Cuesta López De Castro | a 1'37" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 8 | José Ángel Gómez Marchante | a 1'37" | Spagna | Cervélo Test Team |
| 8 | Volodymir Gustov | a 1'37" | Ucraina | Cervélo Test Team |
| 8 | Heinrich Haussler | a 1'37" | Australia | Cervélo Test Team |
| 8 | Thor Hushovd | a 1'37" | Norvegia | Cervélo Test Team |
| 8 | Brett Lancaster | a 1'37" | Australia | Cervélo Test Team |
| 8 | Hayden Roulston | a 1'37" | Nuova Zelanda | Cervélo Test Team |
| 9 | Vladimir Efimkin | a 1'48" | Russia | AG2R La Mondiale |
| 9 | José Luis Arrieta Lujambio | a 1'48" | Spagna | AG2R La Mondiale |
| 9 | Cyril Dessel | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Hubert Dupont | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Stéphane Goubert | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Lloyd Mondory | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Rinaldo Nocentini | a 1'48" | Italia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Christophe Riblon | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 9 | Nicolas Roche | a 1'48" | Francia | AG2R La Mondiale |
| 10 | Igor Antón Hernández | a 2'09" | Spagna | Euskaltel - Euskadi |
