Stefan Schumacher (Gerolsteiner), 2° classificato a 6" da Sánchez Gil e 3° nella generale a 16" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Riccardo Riccò (Saunier Duval - Scott), 13° classificato a 6" da Sánchez Gil e 28° nella generale a 3'52" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito dopo la 4a tappa, e in seguito all'ammissione di aver fatto ricorso a sostanze dopanti sin da prima del via del Tour de France
Bernhard Kohl (Gerolsteiner), 20° classificato a 6" da Sánchez Gil e 15° nella generale a 2'03" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Leonardo Piepoli (Saunier Duval - Scott), 22° classificato a 6" da Sánchez Gil e 58° nella generale a 13'50" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Manuel Beltrán Martínez (Liquigas), 33° classificato a 33" da Sánchez Gil e 26° nella generale a 3'20" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Moises Dueñas Nevado (Barloworld), 40° classificato a 33" da Sánchez Gil e 38° nella generale a 6'39" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito dopo la 4a tappa del Tour de France