Stefan Schumacher (Gerolsteiner), 26° classificato a 0" da Cavendish e 1° nella generale in 19h32'33" con 12" su Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Manuel Beltrán Martínez (Liquigas), 53° classificato a 0" da Cavendish e 37° nella generale a 2'45" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Bernhard Kohl (Gerolsteiner), 63° classificato a 0" da Cavendish e 24° nella generale a 1'35" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France
Riccardo Riccò (Saunier Duval - Scott), 120° classificato a 0" da Cavendish e 59° nella generale a 3'56" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito dopo la 4a tappa, e in seguito all'ammissione di aver fatto ricorso a sostanze dopanti sin da prima del via del Tour de France
Moises Dueñas Nevado (Barloworld), 121° classificato a 0" da Cavendish e 103° nella generale a 6'09" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito dopo la 4a tappa del Tour de France
Leonardo Piepoli (Saunier Duval - Scott), 168° classificato a 0" da Cavendish e 173° a 13'47" da Kirchen, cancellato dall'ordine d'arrivo in seguito a positività all'antidoping riscontrata in un test eseguito alla vigilia del Tour de France