•••••
| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 71 | Adriano Angeloni | a 2'56" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 135 | Alejandro Magallanes Fernández | a 17'12" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 19 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 1'14" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 131 | Alejandro Paleo | a 16'48" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 111 | Alexandre Candido Oliveira | a 4'49" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 39 | Alexis Rodríguez Hernández | a 2'02" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 137 | André Moreira Vital | a 17'57" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 3 | Andreas Klöden | a 15" | Germania | Astana |
| 29 | Andrey Mizurov | a 1'38" | Kazakistan | Astana |
| 30 | Ángel Vicioso Arcos | a 1'39" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 128 | Angelo Furlan | a 16'13" | Italia | Crédit Agricole |
| 134 | Anthony Ravard | a 17'05" | Francia | Agritubel |
| 77 | Antonio Cosme Fraile | a 3'17" | Spagna | Madeinox Boavista |
| 40 | Antonio D'Aniello | a 2'03" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 118 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 5'36" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 37 | Arnaud Labbe | a 2'00" | Francia | Bouygues Telecom |
| 100 | Aurélien Clerc | a 4'02" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 51 | Benoît Joachim | a 2'22" | Lussemburgo | Astana |
| 91 | Benoît Salmon | a 3'45" | Francia | Agritubel |
| 129 | Bruno Antero Lima | a 16'24" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 42 | Bruno Manuel Silva Pires | a 2'04" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 110 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 4'35" | Portogallo | Benfica |
| 54 | Bruno Neves | a 2'27" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 97 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 3'59" | Portogallo | Benfica |
| 98 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 3'59" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 69 | Carlos Nozal Vega | a 2'51" | Spagna | Liberty Seguros |
| 55 | Cedric Coutouly | a 2'28" | Francia | Agritubel |
| 123 | Cédric Herve | a 10'07" | Francia | Agritubel |
| 64 | César Antunes Quiterio | a 2'43" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 7 | Christopher Froome | a 25" | Kenya | Barloworld |
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| Posizione | Ciclista | Distacco | Paese | Squadra |
|---|---|---|---|---|
| 19 | Adriano Angeloni | a 1'13" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 116 | Alejandro Magallanes Fernández | a 3'29" | Spagna | Centro Ciclismo de Loulé |
| 21 | Alejandro Manuel Marque Porto | a 1'14" | Spagna | Palmeiras Resort - Tavira |
| 103 | Alejandro Paleo | a 3'05" | Spagna | Xacobeo Galicia |
| 124 | Alexandre Candido Oliveira | a 3'54" | Portogallo | Centro Ciclismo de Loulé |
| 55 | Alexis Rodríguez Hernández | a 2'02" | Spagna | Fercase - Rota dos Móveis |
| 133 | André Moreira Vital | a 4'14" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 3 | Andreas Klöden | a 18" | Germania | Astana |
| 18 | Andrey Mizurov | a 1'12" | Kazakistan | Astana |
| 37 | Ángel Vicioso Arcos | a 1'41" | Spagna | LA Aluminios - MSS |
| 85 | Angelo Furlan | a 2'40" | Italia | Crédit Agricole |
| 111 | Anthony Ravard | a 3'22" | Francia | Agritubel |
| 106 | Antonio Cosme Fraile | a 3'17" | Spagna | Madeinox Boavista |
| 56 | Antonio D'Aniello | a 2'03" | Italia | Ceramica Flaminia Bossini Docce |
| 137 | Antonio Filipe Oliveira Amorim | a 5'07" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 53 | Arnaud Labbe | a 2'00" | Francia | Bouygues Telecom |
| 107 | Aurélien Clerc | a 3'18" | Svizzera | Bouygues Telecom |
| 47 | Benoît Joachim | a 1'53" | Lussemburgo | Astana |
| 120 | Benoît Salmon | a 3'45" | Francia | Agritubel |
| 88 | Bruno Antero Lima | a 2'41" | Portogallo | Madeinox Boavista |
| 57 | Bruno Manuel Silva Pires | a 2'04" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 99 | Bruno Miguel Castanheira Gomes | a 2'57" | Portogallo | Benfica |
| 83 | Bruno Neves | a 2'36" | Portogallo | LA Aluminios - MSS |
| 104 | Candido Joaquim Venda Moreira Barbosa | a 3'06" | Portogallo | Benfica |
| 126 | Carlos Manuel Pinho Olivera | a 3'59" | Portogallo | Barbot - Siper |
| 77 | Carlos Nozal Vega | a 2'30" | Spagna | Liberty Seguros |
| 60 | Cedric Coutouly | a 2'07" | Francia | Agritubel |
| 141 | Cédric Herve | a 9'08" | Francia | Agritubel |
| 89 | César Antunes Quiterio | a 2'43" | Portogallo | Liberty Seguros |
| 5 | Christopher Froome | a 25" | Kenya | Barloworld |
